Вообще такие вещи лучше писать в саппорт сразу.

У меня что на слабых машинах, что на сильных -- нормально все с загрузкой процессора в Редакторе Скриптов.
Кстати, сколько у Вас там кубиков примерно?
Если пара тысяч, тогда скорее всего тормозит само рисование блок-схемы.

Явно что-то где-то еще происходит в фоне.

ПС Кстати, текстовые источники уже не модно.
Сейчас рулит бинарный поставщик.
Он тоже работает в оффлайне, но в 100 раз удобней текстовиков и примерно во столько же раз быстрее.