Из личного опыта... Для гарантированного сохранения скрипта его нужно выполнить - кнопка Play (как она там подписана) зеленая сверху посередине. Запуск скрипта 1 раз гарантирует сохранение всех галочек и параметров, "синяя дискетка" как-то тоже пару раз подводила, хотя казалось бы действие то тоже...

Перед постановкой скрипта на "боевое дежурство" всегда запускаю его 1 раз и все последние изменения гарантировано сохраняются!

Не исключаю, что это из области шаманства, но за что купил - за то и продаю...