Доходность вычисляется по этой формуле:
http://www.investopedia.com/terms/c/cagr.aspНачальный депозит берется либо из настроек скрипта, либо он равен цене открытия первого бара. Диапазон в годах (месяцах) - это соответственно разница в датах между последним и первым баром.
Разница между двумя скриптами, скорее всего именно в начальном депозите и использовании накопленной прибыли в расчете количества лотов.