При сравнении баров S1 (и тем более, если переделать скрипт на S5), микросекундные расхождения, имхо, не должны оказывать наблюдаемого влияния.

А вот задержки трансляции данных при прохождении через брокерскую систему -- это может давать разницу до сотен мс как мне кажется...