Файл-открыть-график. Выбрать инструмент и период, который используется в агенте. Правой клавишей на графике - перезагрузить данные.
Перед тем как делать скопируйте папки cache и cachetrade на одном уровне с папкой логов(инструменты-папка с логами)
Так как запрос у сервера затрет всю накопленную историю и будет загружено только то, что есть на сервере.
Далее пере-запустить агента.
Если не прокатит и данный день не загрузится, то удалять файлы bin из указанных папок за этот день и снова "перезагрузить данные".
Видимо программу перезапустили не по кнопке, видимо нажали "перезагрузить сейчас", когда вин запросил. Соответственно программа не сбросила накопленные кеши в файл.