так, не совсем понятно. 1 кнопка сохранить конфигурацию выяснили что находится в верхнем левом углу вы на нее стрелочкой показываете на скрине.
4 каких подсказок не хватает. я при наведении обычно вижу подсказки, возможно какие то конкретные имеете ввиду?
и по поводу компоновок. как я и сказал, что окна будут открываться как есть. в опционах чаще всего открывает окно лога, в агентах или лог или график, в скриптах чаще редактор но может и график открываться. сохраняется только расположение закладок (скрипт, агент, стакан и тд)