5 секунд - это временные отсечки, через которые скрипт пересчитывается и перепроверяет все условия:
т.е. для примера скрипт генерит или не генерит сигналы к выходу или входу каждые 5 секунд. Скорость выставления заявок и стопов зависит от интернет канала и брокера обычно в большей степени, нежели мощь компьютера...

По сути - необходимая скорость пересчета зависит от алгоритма. Мой генерит сигналы раз-два-три в день, трендовый. Работает поэтому на пятиминутках.
Если у Вас скальпер, анализирующий по сути движения выражаемые минутами - секундный пересчет может и к месту.