Добрый день!
При запуске программы не загружается последняя сохраненная конфигурация, приходится это делать вручную.
Подскажите, в может быть причина?

Если флаг на месте. Тогда сборку уточните.

Флаг стоит, сборка 1.2.5.0
Это может быть связано с переустановкой ОС и самой программы? Изначально она была установлена на диск D, а после переустановки ОС также переустановил и ТСЛаб уже на диск С

С тем где стоит сама программа это не связано, но если изменилось расположение файла конфигурации то да.
А какие-нибудь сообщения на загрузке выдает?
Во всяком случае лучше создать тикет на http://support.tslab.ru/ и приложить лог программы.

Сообщений никаких не выдает, файл конфигурации лежит в: Документы/TSLab 1.2

Вопрос решился