Как-то странно, и при изменении параметра "Выражение" в формуле и при сохранении параметров скрипт получает признак "измененный", о чем свидетельствует значок '*' в заголовке окна лаборатории. Он у Вас был?
Если признак установлен, то при закрытии окна или всей программы должен был вывестись запрос на сохранение данных скрипта.
Также надо иметь ввиду, что данные скрипта сохраняются не в файле конфигурации, а в баде данных программы. Поэтому сохранение конфигурации, резевная копия тут не помогут.