Хорошо, давайте попробуем. Я реализовал в сборке 1.2.0.70 сохранение компоновки окон для скрипта.
По умолчанию компоновка не сохраняется, чтобы включить сохранение надо включить флажок "Сохранение компоновки" в секции "Внешний вид" в настройках скрипта. После этого при закрытии лаборатории компоновка будет сохраняться в базе данных вместе со скриптом а вызове на редактирование будет восстанавливаться.
Если нужно отказаться от компоновки, надо сбросить флажок, тогда при следующем открытии будет расположение по умолчанию.
Просьба попробовать и отписаться.