Автоматически, но нужно уточнить, поддерживает ли сервер брокера 64бит.
Если не поддерживает, то для торговли и накопления данных используйте 32бит версию, она работает в 64бит системе. При этом все настройки, скрипты будут сохранятся и будут одинаковы для 32бит и 64бит.