я обычно настраиваю рабочее пространство скриптов так, как на скрине

это расположение окон сохраняется только, если скрипт не закрывался
если я сохранил скрипт, закрыл, открыл - настройки воркспейса сбрасываются

очень неудобно

Имеется в виду что при открытии нового скрипта окна сразу так располагались? да, этого нет.
С другой стороны, если вы настроили воркспейс и сохранили, зачем закрывать и опять открывать? Укажите в настройках, чтобы воркспейс перезаписывался только по запросу, или работайте с несколькими воркспейсами.

имеется в виду, что при открытии скрипта воркспейс сбрасывается (либо он не сохраняется)

Более подробно объясните, что значит сбрасывается

открывая снова скрипт, который настроил, как на скрине выше, получаю ненастроенный интерфейс скрипта, по умолчанию

Настройки окон сохраняются не в скрипте, а в воркспейсе. При закрытие окна лаборатории информация об окнах теряется. Поэтому когда открывается новый скрипт информации о расположении окон, которые когда-то были открыты просто нет.

о чём и речь, плохо

принимайте предложение по сохранению параметров