При запущенном скрипте программа не проверяет изменения внешних файлов скриптов. Скрипт уже скомпилирован и выполняется.
Для подхвата изменений достаточно остановить и вновь запустить скрипт. Программа поймет по дате изменения файла внешного скрипта, что необходимо перестроить скрипт.