Если это срочный рынок, то запускаете оба и работаете. они друг другу не мешают. каждый скрипт видит только свои сделки и сигналы. На спот рынке могут возникнуть сложности при открытии двух противоположных сделок. (зависит от брокера, некоторые допускают это).