Очень большая вероятность, что причина в вашем хостинге. Причем как я понял появилось это несколько дней назад, до этого работало нормально. Попробуйте другие программы позапускать, браузер например, сильно ли тормозят. Обычно дешевые хостеры этим страдают, понапродают 100 виртуалок с одной машины, а реально сервер тянет не больше пары десятков.