А я вам объясняю, что нельзя смотреть на пересечения визуально, т.к. шкалы "плывут". Сдвиньте на несколько баров вперед-назад и ваше пересечение исчезнет, потому что одна из шкал пересчитается, а вторая нет. Привяжите к этой шкале еще один график и пересечение исчезнет. Смотреть пересечение можно только по реальным значениям, а не визуально.
Скрипт при работе на графики не смотрит, более-того их вывод на экран совершенно не обязателен и служит только для информации для пользователя.

1. Что значит есть на графике, но нет в менеджере команд? На каком из графиков есть сигнал?
2. на сервере
3. никак, Транзак не предусматривает хранение комментариев к заявкам на сервере, а это обязательное условие трансфера заявок между компьютерами.